在产品的上下游都是关联交易时，产品如何定价就成了关键。虽然各方都声称以市场价格公允交易，但是中科健的毛利率之低，似乎足以说明问题。在关联交易的定价方面，中科健曾经被证监会深圳证管办查出问题:中科健于2002年销售给智联科电子维修有限公司的手机配件及其他约2600万元，该交易毛利率为－45%，产生毛利－1209万元，但智联科销售维修材料的毛利率高达45%，该项销售显示交易定价欠公允。

中科健也努力向人们展示其摆脱关联交易的决心，声称“为解决公司与EZCOM间的关联采购问题，公司已与境外第三方公司进行合作，到2004年11月彻底解决与EZCOM间的关联采购问题。”

除了关联交易导致毛利过低，中科健大量的担保也使其不堪负重。截至2004年6月30日，中科健共有担保余额4亿元。而今年1月19日发布的公告显示，公司约有5亿多元人民币对外担保未履行审批程序，也未履行信息披露义务，而且，担保余额还在清理当中，上诉数据尚不准确。1月18日，上市公司西藏金珠还宣布，中科健共拖欠西藏金珠3.7亿元的款项。而西藏金珠正是马志平所掌控的公司。

2004年12月7日，郝建学辞去中科健总裁职务，广州海纳的王海滨开始筹划进入中科健，但是仅仅三个月之后，王海滨便宣布退出，同时辞职的还有中科院背景的董事长侯自强，郝建学辞职三个月之后，重返中科健。他同时还为中科健带来了一位新总裁王栋，来自上市公司的宏智科技。业界曾流传宏智科技有意收购中科健，但是中科健声称王栋只是以职业经理人身份进入，和股权转让无关。

4月8日，中科健将发布2004年业绩，郝建学也极有可能首次面对一份亏损的年报，亏损还只是开始，郝建学需要面对的还有更多。

马志平受困易美风波